答案是 (3)。
依據土地稅法第39條之1第1項規定：
區段徵收之土地，以現金補償其地價者，依土地稅法第39條第一項前段規定，免徵其土地增值稅。但領回抵價地後第一次移轉時，應以原土地所有權人實際領回抵價地之地價為原地價，計算漲價總數額，課徵土地增值稅，準用土地稅法第30條第一項規定。
區段徵收之土地，依平均地權條例第五十四條第一項、第二項規定以抵價地補償其地價者，免徵土地增值稅。但領回抵價地後第一次移轉時，應以原土地所有權人實際領回抵價地之地價為原地價，計算漲價總數額，課徵土地增值稅，準用土地稅法第30條第一項規定。
因此，參加區段徵收領回抵價地後第一次移轉時，應以原土地所有權人實際領回抵價地之地價為原地價，計算漲價總數額，課徵土地增值稅，但得減徵稅額之百分之四十。
答案 (1)、(2)、(4) 均與土地稅法第39條之1第1項規定不符。
- (1) 免徵土地增值稅：錯誤。 依據土地稅法第39條之1第1項規定，參加區段徵收領回抵價地後第一次移轉時，應以原土地所有權人實際領回抵價地之地價為原地價，計算漲價總數額，課徵土地增值稅，但得減徵稅額之百分之四十。
- (2) 得申請不課徵土地增值稅：錯誤。 依據土地稅法第39條之1第1項規定，參加區段徵收領回抵價地後第一次移轉時，應以原土地所有權人實際領回抵價地之地價為原地價，計算漲價總數額，課徵土地增值稅，但得減徵稅額之百分之四十。
- (4) 得以房地合一稅取代：錯誤。 依據土地稅法第39條之1第1項規定，參加區段徵收領回抵價地後第一次移轉時，應以原土地所有權人實際領回抵價地之地價為原地價，計算漲價總數額，課徵土地增值稅，但得減徵稅額之百分之四十。
以下是參加區段徵收領回抵價地後第一次移轉時，應以原土地所有權人實際領回抵價地之地價為原地價，計算漲價總數額，課徵土地增值稅，但得減徵稅額之百分之四十之理由：
- 為兼顧公平性與土地所有權人之權益。
- 避免因區段徵收而致土地所有權人遭受過多稅負。
土地稅法規定參加區段徵收領回抵價地後第一次移轉時，應以原土地所有權人實際領回抵價地之地價為原地價，計算漲價總數額，課徵土地增值稅，但得減徵稅額之百分之四十，係為兼顧公平性與土地所有權人之權益。
